序列顺序比对工具

序列顺序比对工具（按照生化性质标记颜色） - Sequence Manipulation Suite

序列顺序比对工具（按照生化性质标记颜色）可以分析FASTA格式或者GDE格式的序列，并根据生化性质标记颜色。此工具会检测每一个氨基酸位，如果不同序列的相同氨基酸位氨基酸相同则标记为相应的彩色。您可以配置碱基位相同比率参数（氨基酸相同个数/氨基酸总数），大于此参数的话，标记颜色才会被应用。使用此工具可以用来标记生化性质保守的蛋白片段

粘贴FASTA格式或者GDE格式的序列，输入长度限定在200000以下。

>CremaneiFEM-2
-------------------MSDSLNHPSSSTVHADDGFEPPTSPEDNNKK
PSLEQIKQEREALFTDLFADRRRSARSVIEEAFQNELMSAEPVQPNVPN-
-PHSIPIRFRHQPVAGPAHDVFGDAVHSIFQKIMSRGVNADYSHWMSYWI
ALGIDKKT-QMNYHMKPFCKDTYATEGSLEAKQTFTDKIRSAVEEIIWKS
AEYCDILSEKWTGIHVSADQLKGQRNKQEDRFVAYPNGQYMNRGQ-SDIS
LLAVFDGHGGHECSQYAAAHFWEAWSDAQHHHSQDMKLDELLEKALETLD
ERMTVRSVRESWKGGTTAVCCAVDLNTNQIAFAWLGDSPGYIMSNLEFRK
FTTEHSPSDPEECRRVEEVGGQIFVIGGELRVNGVLNLTRALGDVPGRPM
ISNKPDTLLKTIEPADYLVLLACDGISDVFNTSDLYNLVQAFVNEYDVED
YHELARYICNQAVSAGSADNVTVVIGFLRPPEDVWRVMKTDSDDEESELE
EEDDNE
>CelegansFEM-2
--------------------------------------------------
--MEKVNEERDAVFEDHIGDRRRSVRSLLEEAFADEMEKTSYDVEVADTP
-QPHIPIRFRHPPIAGPVHDVFGDAIHDIFQKMMKRGQAVDFCHWVSHLI
ATEIDEKFSEVAFRDVQYNPDIYVTDSTTEAKKLFNDKIWPAIDKILQQN
AETCPILSEKWSGIHVSGDQLKGQRHKQEDRFLAYPNGQYMDRGE-DPIS
VLAVFDGHGGHECSQYAAGHLWETWLEVRKSRDPSDSLEDQLRKSLELLD
ERMTVRSVKECWKGGSTAVCCAIDMDQKLMALAWLGDSPGYVMSNIEFRQ
LTRGHSPSDEREARRVEEAGGQLFVIGGELRVNGVLNLTRALGDVPGRPM
ISNEPETCQVPIESSDYLVLLACDGISDVFNERDLYQLVEAFANDYPVED
YAELSRFICTKAIEAGSADNVSVVIGFLRPPQDVWKLMKHESDDEDSDVT
DEE---
>CbriggsaeFEM-2
MSGPPPPKTNEKSSQPVTGRSQEPTRKGQLGPNYLRIIEEDEEYGHALLE
PSEEQIKFEREALFEDLHLDRQRSARSFIEETFEEEMLGPQNGIPPTTES
PQSYIPIRYRNPPAAAPVHDVFGDAVHAIFQKLMTRGPPVEYCHWMSYWI
AKQIDKDS-PVKYHECRFTPDQYVTENTAEAKKTYMDNMWKAAEKNLWMY
TYNSPLLRTKWTGIHVSAEQIKGQRHKQEDRFVAYPNSLYMDTSRSDHIA
LLGVFDGHGGHECSQYAAGHMWETWIETRASHFEEP-LEKQLKTSLDLLD
ERMTVRSTKECWKGGTTAVCCAIDMNKKELAFAWLGDSPGYIMDNLEVRK
VTRDHSPSDPEEGRRVEEAGGQLFVIGGELRVNGVLNLTRALGDVPGRPM
ISNQAETCQRDIEVGDYLVILACDGISDVFNTSDLYNLVQAYVNENPVEE
YNDLAHYICHEAIAHGSTDNVTVVIGFLRPPQDLWRMMKIDEESDEEEDE
VDDE--

每行显示个氨基酸残基..
碱基位相同比率达到: %颜色才被用于标记
颜色标记方法 .

输入每条序列比对的开始位置，形式如0, 200, 0, -1。如果位置未被指定，则默认为序列从头开始（0位）。

* 此工具需要浏览器支持JavaScript. 详情请见浏览器兼容性介绍.

* 您可以镜像此工具到自己的网站 or也可以单机使用