Fuzzy Search DNA
DNA模糊查找工具,会根据输入的子串及设定的规则在目标序列中查找相似子串(类似blast的查找方法)。它与
DNA模式分析器
的区别在于,DNA模式分析器事先明确知道要查找的字段的模式,而此工具能筛选出事前不知道的所有可能突变。
输入原始序列或者FASTA格式的序列,长度限定在2000以内
>test sequence gacttgtggaacctacttcctgaaaataaccttctgtcctccgagctctccgcacccgtg gatgacctgctcccgtacacagatgttgccacctggctggatgaatgtccgaatgaagcg tactgcct
输入期望匹配的序列,长度限定在30以内.
配置如下参数以计算相似程度
*匹配得
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
分
*错配得
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
分
*跳配得
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
分
*显示前
40
30
20
10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
个.
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