引物模板匹配工具
引物模板匹配工具可以用格式化文字的方式将引物映射到模板上，用以展示PCR引物的退火位置。限制性酶切位点及翻译后的蛋白序列也会展示在结果中。当需要为模板设计大量引物时，此工具特别有用。此工具支持所有IUPAC字符和多种密码子表。
输入原始序列或者1到多条FASTA序列，长度限制在200000以内。
>sample sequence cagctggggggaggtggcgaggaagatgacgtggtcgaggtcgacggtatcgagttgtcgcggcagctgccaatacgactcactatagaggagaagtagcaagaaaaataacatgataattatcacgacaactacctggtgatgttgctagtaatattacttgttatttttctcgtcatcttcccggcgacgtcgccagcaacatctttagtgagggttaatcacctgctacttctcccgccacctccc
输入需要展示的引物信息。形如: (T7) aatacgactcactatag。圆括号是引物的名字, 序列书写方向5'到3'。多条引物时，需要用逗号隔开。
(reverse) aacagctatgaccatg, (T3) attaaccctcactaaag, (KS) cgaggtcgacggtatcg, (SK) tctagaactagtggatc, (T7) aatacgactcactatag, (-40) gttttcccagtcacgac, (Sp6) atttaggtgacactatag, (M13 for) gtaaaacgacggccagt, (M13 rev) cacacaggaaacagctatgaccat, (BGH rev) tagaaggcacagtcgagg, (pGEX for) ctggcaagccacgtttggtg, (pGEX rev) ggagctgcatgtgtcagagg, (T7-EEV aaggctagagtacttaatacga, (pUC/M13 Forward) gttttcccagtcacgac, (pUC/M13 forward) cgccagggttttcccagtcacgac, (pUC/M13 reverse) caggaaacagctatgac, (pUC/M13 reverse) tcacacaggaaacagctatgac, (Glprimer1) tgtatcttatggtactgtaactg, (GLprimer2) ctttatgtttttggcgtcttcca, (RVprimer3) ctagcaaaataggctgtccc, (RVprimer4) gacgatagtcatgccccgcg, (Lambda gt11 Forward) ggtggcgacgactcctggagcccg, (Lambda gt11 Reverse) ttgacaccagaccaactggtaatg, (Lambda gt10 Forward) cttttgagcaagttcagcctggttaag, (lambda gt10 Reverse) gaggtggcttatgagtatttcttccagggta, (Pinpoint Sequencing) cgtgacgcggtgcagggcg, (pTarget Sequencing) ttacgccaagttatttaggtgaca
* 每行显示
105
90
75
60
45
30
个碱基。
* 翻译开始位置
1
2
3
1, 2, and 3
大写
none
* 使用
standard (1)
vertebrate mitochondrial (2)
yeast mitochondrial (3)
mold mitochondrial (4)
invertebrate mitochondrial (5)
ciliate nuclear (6)
echinoderm mitochondrial (9)
euplotid nuclear (10)
bacterial (11)
alternative yeast nuclear (12)
ascidian mitochondrial (13)
flatworm mitochondrial (14)
Blepharisma macronuclear (15)
chlorophycean mitochondrial (16)
trematode mitochondrial (21)
Scenedesmus obliquus mitochondrial (22)
Thraustochytrium mitochondrial (23)
密码子表
.
* 限制性酶切位点
展示
不展示
* 序列为
线性
环形
分子.
* 输出
彩色
黑白
结果.
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